Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPC3Q13507 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPC3Q13507 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRPC3Q13507 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC3Q13507 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC3Q13507 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC3Q13507 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC3Q13507 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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