Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHAF1BQ13112 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1BQ13112 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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