Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT88Q13099 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
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