Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPS1Q13098 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GPS1Q13098 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
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