Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM32Q13049 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM32Q13049 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM32Q13049 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM32Q13049 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM32Q13049 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM32Q13049 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM32Q13049 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM32Q13049 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM32Q13049 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM32Q13049 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM32Q13049 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM32Q13049 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM32Q13049 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM32Q13049 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM32Q13049 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM32Q13049 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM32Q13049 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM32Q13049 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM32Q13049 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM32Q13049 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM32Q13049 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM32Q13049 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM32Q13049 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM32Q13049 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms