Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC10A2Q12908 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC10A2Q12908 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A2Q12908 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms