Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTN1Q12860 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN1Q12860 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
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