Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAPQ12770 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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