Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYCNQ0VAF6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYCNQ0VAF6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms