Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIPPLY1Q0D2K3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms