Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LOXL1Q08397 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms