Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP3CAQ08209 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP3CAQ08209 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP3CAQ08209 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms