Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4BQ07343 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4BQ07343 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4BQ07343 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4BQ07343 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4BQ07343 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4BQ07343 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4BQ07343 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4BQ07343 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4BQ07343 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4BQ07343 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4BQ07343 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4BQ07343 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4BQ07343 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4BQ07343 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4BQ07343 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4BQ07343 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4BQ07343 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4BQ07343 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4BQ07343 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4BQ07343 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4BQ07343 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4BQ07343 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4BQ07343 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4BQ07343 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4BQ07343 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4BQ07343 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4BQ07343 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4BQ07343 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4BQ07343 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4BQ07343 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4BQ07343 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4BQ07343 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4BQ07343 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4BQ07343 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4BQ07343 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms