Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.551e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.551e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-211ENST00000434168 862 ntTSL 324.29■■□□□ 1.481e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.41e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-216ENST00000450664 570 ntTSL 423.43■■□□□ 1.341e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.281e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.261e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-219ENST00000471707 745 ntTSL 521.53■■□□□ 1.041e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 11e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 PARG-204ENST00000610922 1487 ntTSL 221.09■□□□□ 0.971e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.955e-24■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ZNF783-203ENST00000476295 2346 ntTSL 220.83■□□□□ 0.921e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-203ENST00000399807 2241 ntTSL 520.53■□□□□ 0.881e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ATF7IP2-216ENST00000569900 559 ntTSL 420.53■□□□□ 0.882e-16■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.811e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ATF7IP2-207ENST00000561932 538 ntTSL 419.45■□□□□ 0.72e-16■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 SLCO2B1-207ENST00000526660 582 ntTSL 319.14■□□□□ 0.651e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ZNF783-204ENST00000481519 1929 ntTSL 218.51■□□□□ 0.551e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 FAM83H-202ENST00000395103 3611 ntTSL 218.37■□□□□ 0.531e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-220ENST00000475446 557 ntTSL 418.2■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ZNF783-205ENST00000489518 763 ntTSL 318.19■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.491e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 BOP1-203ENST00000569160 734 ntTSL 217.89■□□□□ 0.451e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 PKP4-205ENST00000426248 4134 ntTSL 1 (best)17.5■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 LDAH-203ENST00000402479 493 ntTSL 317.36■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ZNF627-203ENST00000587939 591 ntTSL 417.25■□□□□ 0.351e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.31e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 LDAH-205ENST00000412261 566 ntTSL 416.84■□□□□ 0.291e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.261e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ZNF783-201ENST00000378052 2876 ntTSL 216.58■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.195e-24■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 PARG-205ENST00000611974 1242 ntTSL 515.92■□□□□ 0.141e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-209ENST00000432198 585 ntTSL 415.19■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 MITF-216ENST00000495741 473 ntTSL 415.02■□□□□ -01e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 MITF-211ENST00000457080 382 ntTSL 1 (best)15.01□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ARPC4-TTLL3-203ENST00000424442 903 ntTSL 514.8□□□□□ -0.045e-24■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 UBTF-212ENST00000531368 431 ntTSL 214.72□□□□□ -0.055e-11■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 LDAH-213ENST00000626491 1179 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.061e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 FANCA-219ENST00000566133 761 ntTSL 314.56□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 LDAH-204ENST00000403006 1895 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 AC005381.1-201ENST00000593065 769 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.118e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ARPC4-TTLL3-202ENST00000418163 551 ntTSL 414.27□□□□□ -0.135e-24■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ZNRF1-210ENST00000568844 5331 nt14.25□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 LDAH-207ENST00000432947 548 ntTSL 413.92□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ZNF627-201ENST00000361113 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.241e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 LDAH-202ENST00000381090 2045 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.291e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ZNF627-204ENST00000588174 2755 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.311e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ZNF627-206ENST00000593279 588 ntTSL 412.55□□□□□ -0.41e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 PARG-201ENST00000402038 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ATF7IP2-205ENST00000535850 1907 ntTSL 212.39□□□□□ -0.432e-16■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 FANCA-225ENST00000567621 618 ntTSL 312.21□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ATF7IP2-210ENST00000562527 625 ntTSL 312.14□□□□□ -0.472e-16■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 LDAH-206ENST00000419825 826 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.471e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ATF7IP2-217ENST00000569939 564 ntTSL 411.86□□□□□ -0.512e-16■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 SLCO2B1-215ENST00000531713 578 ntTSL 311.75□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 PARG-206ENST00000614063 3473 ntTSL 211.62□□□□□ -0.551e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ZNF627-202ENST00000585493 541 ntTSL 410.98□□□□□ -0.651e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 CAST-225ENST00000509259 565 ntTSL 410.79□□□□□ -0.681e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.71e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 CSNK2A1-210ENST00000619801 655 ntTSL 310.55□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TRPM7-207ENST00000560955 7218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.771e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TCP1-218ENST00000546204 566 ntTSL 210.03□□□□□ -0.81e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 LDAH-201ENST00000237822 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.871e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.871e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ARPC4-TTLL3-204ENST00000453882 499 ntTSL 49.6□□□□□ -0.875e-24■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.92e-16■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 LDAH-208ENST00000435420 3837 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -11e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.011e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ATF7IP2-208ENST00000562102 558 ntTSL 48.58□□□□□ -1.042e-16■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.121e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.162e-16■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.252e-16■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ATF7IP2-211ENST00000564797 450 ntTSL 37.24□□□□□ -1.252e-16■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.271e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 BIRC6-209ENST00000471232 4226 ntTSL 27.06□□□□□ -1.281e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.281e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.321e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.391e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 HDAC2-215ENST00000523334 4810 ntTSL 24.33□□□□□ -1.721e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.81e-7■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.21□□□□□ -2.221e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.575e-8■■■■■ 30.7
FMR1Q06787 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.335e-8■■■■■ 30.7
FMR1Q06787 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.135e-8■■■■■ 30.7
FMR1Q06787 SLC4A2-207ENST00000469355 464 ntTSL 222.55■■□□□ 1.27e-7■■■■■ 30.7
FMR1Q06787 VARS-225ENST00000482996 728 ntTSL 317.37■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 30.7
FMR1Q06787 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 30.6
FMR1Q06787 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 30.6
FMR1Q06787 GRB2-211ENST00000583912 561 ntTSL 410.53□□□□□ -0.726e-11■■■■■ 30.6
FMR1Q06787 CHD8-208ENST00000555301 918 ntTSL 217.03■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 30.6
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 64.5 ms