Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX8Q06710 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAX8Q06710 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX8Q06710 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms