Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms