Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DEUP1Q05D60 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEUP1Q05D60 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEUP1Q05D60 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms