Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNP2Q05952 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNP2Q05952 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms