Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTK2Q05397 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTK2Q05397 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms