Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSBP1Q04837 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms