Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCQQ04759 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCQQ04759 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms