Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RELAQ04206 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RELAQ04206 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RELAQ04206 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RELAQ04206 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RELAQ04206 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RELAQ04206 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RELAQ04206 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RELAQ04206 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RELAQ04206 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RELAQ04206 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RELAQ04206 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RELAQ04206 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RELAQ04206 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RELAQ04206 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RELAQ04206 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RELAQ04206 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RELAQ04206 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RELAQ04206 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RELAQ04206 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RELAQ04206 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RELAQ04206 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RELAQ04206 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RELAQ04206 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RELAQ04206 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RELAQ04206 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RELAQ04206 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RELAQ04206 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RELAQ04206 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RELAQ04206 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RELAQ04206 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RELAQ04206 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RELAQ04206 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RELAQ04206 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RELAQ04206 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RELAQ04206 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RELAQ04206 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RELAQ04206 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RELAQ04206 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RELAQ04206 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RELAQ04206 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RELAQ04206 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RELAQ04206 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RELAQ04206 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RELAQ04206 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RELAQ04206 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RELAQ04206 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RELAQ04206 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RELAQ04206 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RELAQ04206 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RELAQ04206 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RELAQ04206 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RELAQ04206 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RELAQ04206 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RELAQ04206 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RELAQ04206 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RELAQ04206 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RELAQ04206 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RELAQ04206 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RELAQ04206 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RELAQ04206 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RELAQ04206 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RELAQ04206 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RELAQ04206 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RELAQ04206 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RELAQ04206 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RELAQ04206 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RELAQ04206 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RELAQ04206 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RELAQ04206 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RELAQ04206 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RELAQ04206 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RELAQ04206 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RELAQ04206 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RELAQ04206 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RELAQ04206 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RELAQ04206 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RELAQ04206 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RELAQ04206 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RELAQ04206 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RELAQ04206 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RELAQ04206 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RELAQ04206 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RELAQ04206 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RELAQ04206 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RELAQ04206 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RELAQ04206 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RELAQ04206 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RELAQ04206 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RELAQ04206 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RELAQ04206 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RELAQ04206 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RELAQ04206 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RELAQ04206 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RELAQ04206 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RELAQ04206 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RELAQ04206 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RELAQ04206 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RELAQ04206 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RELAQ04206 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms