Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CNTN2Q02246 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTN2Q02246 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms