Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ROR1Q01973 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ROR1Q01973 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms