Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TFAP4Q01664 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TFAP4Q01664 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms