Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK17Q00537 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK17Q00537 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms