Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK16Q00536 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK16Q00536 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK16Q00536 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms