Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNC1P63316 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNC1P63316 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms