Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP46P62068 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP46P62068 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP46P62068 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP46P62068 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP46P62068 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP46P62068 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP46P62068 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP46P62068 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP46P62068 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP46P62068 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP46P62068 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP46P62068 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP46P62068 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP46P62068 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP46P62068 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP46P62068 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP46P62068 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP46P62068 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP46P62068 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP46P62068 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP46P62068 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP46P62068 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP46P62068 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP46P62068 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP46P62068 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP46P62068 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP46P62068 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP46P62068 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP46P62068 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP46P62068 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP46P62068 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP46P62068 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP46P62068 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP46P62068 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP46P62068 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP46P62068 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP46P62068 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP46P62068 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP46P62068 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP46P62068 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP46P62068 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP46P62068 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP46P62068 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP46P62068 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP46P62068 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP46P62068 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP46P62068 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP46P62068 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP46P62068 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP46P62068 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP46P62068 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP46P62068 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP46P62068 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP46P62068 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP46P62068 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP46P62068 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP46P62068 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP46P62068 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP46P62068 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP46P62068 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP46P62068 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP46P62068 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP46P62068 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP46P62068 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP46P62068 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP46P62068 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP46P62068 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP46P62068 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP46P62068 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP46P62068 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP46P62068 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP46P62068 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP46P62068 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP46P62068 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP46P62068 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP46P62068 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP46P62068 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP46P62068 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP46P62068 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP46P62068 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP46P62068 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP46P62068 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP46P62068 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP46P62068 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP46P62068 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP46P62068 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP46P62068 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP46P62068 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP46P62068 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP46P62068 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP46P62068 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP46P62068 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP46P62068 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP46P62068 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP46P62068 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP46P62068 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP46P62068 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP46P62068 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP46P62068 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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