Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPS3AP61247 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS3AP61247 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms