Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.3 ms