Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXW4P57775 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXW4P57775 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXW4P57775 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXW4P57775 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXW4P57775 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXW4P57775 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXW4P57775 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXW4P57775 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms