Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA9P57773 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA9P57773 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA9P57773 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA9P57773 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA9P57773 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJA9P57773 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA9P57773 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA9P57773 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJA9P57773 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA9P57773 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA9P57773 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA9P57773 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA9P57773 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA9P57773 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJA9P57773 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA9P57773 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA9P57773 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA9P57773 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA9P57773 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA9P57773 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA9P57773 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJA9P57773 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA9P57773 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA9P57773 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA9P57773 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA9P57773 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA9P57773 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA9P57773 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA9P57773 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA9P57773 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA9P57773 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA9P57773 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA9P57773 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA9P57773 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA9P57773 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA9P57773 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA9P57773 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA9P57773 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA9P57773 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA9P57773 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA9P57773 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA9P57773 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA9P57773 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA9P57773 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA9P57773 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA9P57773 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA9P57773 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA9P57773 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA9P57773 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA9P57773 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA9P57773 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA9P57773 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA9P57773 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA9P57773 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA9P57773 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GJA9P57773 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA9P57773 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA9P57773 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA9P57773 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA9P57773 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA9P57773 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA9P57773 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA9P57773 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA9P57773 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA9P57773 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA9P57773 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA9P57773 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA9P57773 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA9P57773 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA9P57773 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA9P57773 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA9P57773 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA9P57773 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA9P57773 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA9P57773 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA9P57773 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA9P57773 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA9P57773 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA9P57773 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA9P57773 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA9P57773 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA9P57773 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA9P57773 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA9P57773 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA9P57773 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA9P57773 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA9P57773 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA9P57773 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA9P57773 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA9P57773 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA9P57773 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA9P57773 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA9P57773 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA9P57773 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA9P57773 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA9P57773 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA9P57773 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA9P57773 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA9P57773 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms