Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NRG3P56975 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NRG3P56975 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRG3P56975 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRG3P56975 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRG3P56975 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRG3P56975 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRG3P56975 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRG3P56975 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRG3P56975 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRG3P56975 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRG3P56975 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRG3P56975 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRG3P56975 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRG3P56975 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRG3P56975 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRG3P56975 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRG3P56975 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRG3P56975 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRG3P56975 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRG3P56975 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRG3P56975 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRG3P56975 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRG3P56975 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRG3P56975 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRG3P56975 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRG3P56975 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRG3P56975 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRG3P56975 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRG3P56975 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRG3P56975 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRG3P56975 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NRG3P56975 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRG3P56975 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRG3P56975 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRG3P56975 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRG3P56975 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRG3P56975 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRG3P56975 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRG3P56975 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRG3P56975 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRG3P56975 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRG3P56975 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRG3P56975 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NRG3P56975 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRG3P56975 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NRG3P56975 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NRG3P56975 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NRG3P56975 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRG3P56975 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRG3P56975 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRG3P56975 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRG3P56975 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRG3P56975 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRG3P56975 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRG3P56975 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRG3P56975 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRG3P56975 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRG3P56975 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRG3P56975 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRG3P56975 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRG3P56975 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRG3P56975 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRG3P56975 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRG3P56975 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRG3P56975 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRG3P56975 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRG3P56975 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRG3P56975 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRG3P56975 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRG3P56975 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRG3P56975 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRG3P56975 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRG3P56975 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRG3P56975 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRG3P56975 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRG3P56975 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRG3P56975 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRG3P56975 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRG3P56975 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRG3P56975 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRG3P56975 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NRG3P56975 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRG3P56975 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRG3P56975 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRG3P56975 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRG3P56975 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRG3P56975 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NRG3P56975 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRG3P56975 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRG3P56975 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRG3P56975 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRG3P56975 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRG3P56975 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRG3P56975 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRG3P56975 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRG3P56975 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRG3P56975 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRG3P56975 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRG3P56975 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms