Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN8P56748 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN8P56748 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms