Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
MTCP1P56278 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTCP1P56278 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms