Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH13P55290 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH13P55290 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH13P55290 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH13P55290 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH13P55290 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH13P55290 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH13P55290 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH13P55290 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH13P55290 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH13P55290 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH13P55290 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH13P55290 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH13P55290 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH13P55290 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH13P55290 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH13P55290 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH13P55290 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH13P55290 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH13P55290 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH13P55290 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH13P55290 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH13P55290 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH13P55290 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH13P55290 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDH13P55290 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH13P55290 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH13P55290 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH13P55290 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH13P55290 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH13P55290 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH13P55290 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH13P55290 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH13P55290 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH13P55290 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH13P55290 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH13P55290 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH13P55290 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH13P55290 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH13P55290 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH13P55290 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH13P55290 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH13P55290 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH13P55290 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH13P55290 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH13P55290 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH13P55290 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH13P55290 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH13P55290 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH13P55290 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH13P55290 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH13P55290 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH13P55290 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH13P55290 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH13P55290 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH13P55290 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH13P55290 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH13P55290 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH13P55290 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH13P55290 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH13P55290 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH13P55290 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH13P55290 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH13P55290 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH13P55290 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH13P55290 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH13P55290 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH13P55290 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH13P55290 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH13P55290 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH13P55290 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH13P55290 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH13P55290 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH13P55290 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH13P55290 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH13P55290 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH13P55290 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH13P55290 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH13P55290 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH13P55290 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH13P55290 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH13P55290 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH13P55290 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH13P55290 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH13P55290 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH13P55290 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH13P55290 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH13P55290 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH13P55290 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH13P55290 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH13P55290 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH13P55290 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH13P55290 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH13P55290 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH13P55290 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH13P55290 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH13P55290 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH13P55290 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH13P55290 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH13P55290 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms