Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NCKAP1LP55160 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCKAP1LP55160 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NCKAP1LP55160 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms