Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NAPAP54920 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAPAP54920 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAPAP54920 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAPAP54920 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAPAP54920 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAPAP54920 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAPAP54920 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAPAP54920 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NAPAP54920 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NAPAP54920 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NAPAP54920 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NAPAP54920 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NAPAP54920 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NAPAP54920 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NAPAP54920 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NAPAP54920 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NAPAP54920 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NAPAP54920 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NAPAP54920 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NAPAP54920 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAPAP54920 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAPAP54920 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAPAP54920 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAPAP54920 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAPAP54920 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAPAP54920 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAPAP54920 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NAPAP54920 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAPAP54920 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAPAP54920 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NAPAP54920 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NAPAP54920 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NAPAP54920 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NAPAP54920 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NAPAP54920 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NAPAP54920 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NAPAP54920 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NAPAP54920 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAPAP54920 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAPAP54920 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAPAP54920 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAPAP54920 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAPAP54920 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAPAP54920 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAPAP54920 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NAPAP54920 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NAPAP54920 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NAPAP54920 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NAPAP54920 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NAPAP54920 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NAPAP54920 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NAPAP54920 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NAPAP54920 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NAPAP54920 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NAPAP54920 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NAPAP54920 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NAPAP54920 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NAPAP54920 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAPAP54920 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAPAP54920 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAPAP54920 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAPAP54920 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAPAP54920 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAPAP54920 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAPAP54920 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAPAP54920 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAPAP54920 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NAPAP54920 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAPAP54920 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAPAP54920 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAPAP54920 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAPAP54920 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NAPAP54920 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NAPAP54920 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NAPAP54920 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NAPAP54920 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NAPAP54920 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAPAP54920 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAPAP54920 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAPAP54920 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAPAP54920 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NAPAP54920 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAPAP54920 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAPAP54920 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NAPAP54920 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAPAP54920 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAPAP54920 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAPAP54920 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAPAP54920 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAPAP54920 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAPAP54920 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAPAP54920 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAPAP54920 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAPAP54920 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NAPAP54920 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NAPAP54920 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NAPAP54920 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NAPAP54920 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NAPAP54920 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms