Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRLP54845 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRLP54845 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRLP54845 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRLP54845 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRLP54845 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRLP54845 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRLP54845 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRLP54845 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRLP54845 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRLP54845 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRLP54845 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRLP54845 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRLP54845 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRLP54845 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRLP54845 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NRLP54845 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRLP54845 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NRLP54845 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRLP54845 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRLP54845 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRLP54845 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRLP54845 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRLP54845 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRLP54845 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRLP54845 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRLP54845 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRLP54845 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NRLP54845 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRLP54845 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRLP54845 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRLP54845 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NRLP54845 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRLP54845 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRLP54845 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRLP54845 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRLP54845 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRLP54845 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRLP54845 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NRLP54845 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRLP54845 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRLP54845 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRLP54845 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRLP54845 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NRLP54845 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRLP54845 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRLP54845 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NRLP54845 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRLP54845 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRLP54845 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRLP54845 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NRLP54845 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRLP54845 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRLP54845 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRLP54845 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRLP54845 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRLP54845 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRLP54845 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRLP54845 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRLP54845 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRLP54845 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRLP54845 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRLP54845 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRLP54845 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRLP54845 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRLP54845 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRLP54845 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRLP54845 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRLP54845 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRLP54845 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRLP54845 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRLP54845 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRLP54845 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRLP54845 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRLP54845 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRLP54845 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRLP54845 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRLP54845 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRLP54845 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRLP54845 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRLP54845 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRLP54845 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRLP54845 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRLP54845 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRLP54845 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRLP54845 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NRLP54845 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRLP54845 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRLP54845 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRLP54845 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRLP54845 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRLP54845 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRLP54845 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRLP54845 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRLP54845 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRLP54845 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRLP54845 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRLP54845 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRLP54845 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRLP54845 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms