Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB3P54753 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPHB3P54753 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB3P54753 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms