Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLNS1AP54105 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLNS1AP54105 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLNS1AP54105 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms