Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DAP3P51398 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DAP3P51398 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DAP3P51398 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DAP3P51398 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DAP3P51398 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DAP3P51398 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DAP3P51398 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DAP3P51398 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DAP3P51398 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DAP3P51398 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DAP3P51398 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DAP3P51398 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DAP3P51398 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DAP3P51398 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DAP3P51398 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DAP3P51398 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DAP3P51398 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DAP3P51398 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DAP3P51398 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DAP3P51398 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DAP3P51398 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DAP3P51398 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DAP3P51398 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DAP3P51398 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DAP3P51398 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DAP3P51398 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DAP3P51398 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DAP3P51398 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DAP3P51398 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DAP3P51398 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DAP3P51398 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DAP3P51398 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DAP3P51398 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DAP3P51398 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DAP3P51398 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DAP3P51398 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DAP3P51398 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DAP3P51398 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DAP3P51398 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DAP3P51398 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DAP3P51398 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DAP3P51398 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DAP3P51398 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DAP3P51398 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DAP3P51398 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DAP3P51398 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DAP3P51398 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DAP3P51398 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DAP3P51398 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DAP3P51398 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DAP3P51398 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DAP3P51398 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DAP3P51398 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DAP3P51398 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DAP3P51398 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DAP3P51398 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DAP3P51398 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DAP3P51398 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DAP3P51398 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DAP3P51398 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DAP3P51398 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DAP3P51398 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DAP3P51398 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DAP3P51398 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DAP3P51398 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DAP3P51398 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DAP3P51398 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DAP3P51398 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DAP3P51398 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DAP3P51398 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DAP3P51398 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DAP3P51398 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DAP3P51398 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DAP3P51398 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DAP3P51398 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DAP3P51398 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DAP3P51398 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DAP3P51398 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DAP3P51398 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DAP3P51398 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DAP3P51398 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DAP3P51398 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DAP3P51398 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DAP3P51398 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DAP3P51398 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DAP3P51398 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DAP3P51398 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DAP3P51398 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DAP3P51398 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DAP3P51398 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DAP3P51398 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DAP3P51398 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DAP3P51398 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DAP3P51398 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DAP3P51398 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DAP3P51398 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DAP3P51398 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DAP3P51398 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DAP3P51398 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms