Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB27AP51159 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB27AP51159 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB27AP51159 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB27AP51159 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB27AP51159 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB27AP51159 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB27AP51159 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB27AP51159 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB27AP51159 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms