Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A2P50993 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A2P50993 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A2P50993 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP1A2P50993 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A2P50993 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A2P50993 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A2P50993 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A2P50993 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A2P50993 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A2P50993 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A2P50993 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A2P50993 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms