Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ETV1P50549 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ETV1P50549 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ETV1P50549 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ETV1P50549 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ETV1P50549 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ETV1P50549 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ETV1P50549 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ETV1P50549 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ETV1P50549 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ETV1P50549 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ETV1P50549 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ETV1P50549 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ETV1P50549 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ETV1P50549 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ETV1P50549 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ETV1P50549 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ETV1P50549 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ETV1P50549 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ETV1P50549 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ETV1P50549 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ETV1P50549 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ETV1P50549 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV1P50549 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV1P50549 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV1P50549 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV1P50549 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV1P50549 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV1P50549 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV1P50549 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV1P50549 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV1P50549 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV1P50549 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV1P50549 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV1P50549 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV1P50549 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV1P50549 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV1P50549 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV1P50549 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV1P50549 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV1P50549 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV1P50549 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV1P50549 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV1P50549 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV1P50549 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV1P50549 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV1P50549 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV1P50549 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV1P50549 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV1P50549 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV1P50549 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV1P50549 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV1P50549 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV1P50549 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV1P50549 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV1P50549 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV1P50549 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV1P50549 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV1P50549 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV1P50549 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV1P50549 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV1P50549 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV1P50549 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV1P50549 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV1P50549 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV1P50549 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV1P50549 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV1P50549 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV1P50549 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV1P50549 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV1P50549 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV1P50549 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV1P50549 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV1P50549 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV1P50549 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV1P50549 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV1P50549 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ETV1P50549 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ETV1P50549 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ETV1P50549 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ETV1P50549 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ETV1P50549 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ETV1P50549 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ETV1P50549 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263.9 ms