Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRE11P49959 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRE11P49959 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRE11P49959 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRE11P49959 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRE11P49959 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MRE11P49959 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRE11P49959 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRE11P49959 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRE11P49959 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRE11P49959 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRE11P49959 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRE11P49959 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRE11P49959 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRE11P49959 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRE11P49959 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRE11P49959 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRE11P49959 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MRE11P49959 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MRE11P49959 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MRE11P49959 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MRE11P49959 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MRE11P49959 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MRE11P49959 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MRE11P49959 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MRE11P49959 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRE11P49959 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRE11P49959 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRE11P49959 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRE11P49959 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRE11P49959 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRE11P49959 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRE11P49959 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRE11P49959 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRE11P49959 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRE11P49959 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRE11P49959 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRE11P49959 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRE11P49959 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRE11P49959 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRE11P49959 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRE11P49959 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRE11P49959 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRE11P49959 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRE11P49959 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRE11P49959 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRE11P49959 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRE11P49959 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRE11P49959 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRE11P49959 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRE11P49959 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRE11P49959 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MRE11P49959 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRE11P49959 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRE11P49959 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRE11P49959 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRE11P49959 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRE11P49959 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRE11P49959 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRE11P49959 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRE11P49959 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRE11P49959 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRE11P49959 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRE11P49959 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRE11P49959 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRE11P49959 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRE11P49959 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRE11P49959 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRE11P49959 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRE11P49959 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRE11P49959 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRE11P49959 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRE11P49959 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRE11P49959 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRE11P49959 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MRE11P49959 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MRE11P49959 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MRE11P49959 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MRE11P49959 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MRE11P49959 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRE11P49959 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRE11P49959 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRE11P49959 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRE11P49959 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRE11P49959 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRE11P49959 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRE11P49959 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRE11P49959 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms