Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPFP49454 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPFP49454 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPFP49454 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPFP49454 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPFP49454 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPFP49454 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPFP49454 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPFP49454 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPFP49454 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPFP49454 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPFP49454 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPFP49454 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPFP49454 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPFP49454 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPFP49454 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPFP49454 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPFP49454 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPFP49454 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPFP49454 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPFP49454 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPFP49454 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPFP49454 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPFP49454 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPFP49454 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPFP49454 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPFP49454 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPFP49454 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPFP49454 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPFP49454 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPFP49454 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPFP49454 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPFP49454 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPFP49454 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CENPFP49454 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CENPFP49454 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPFP49454 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPFP49454 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPFP49454 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPFP49454 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPFP49454 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPFP49454 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPFP49454 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPFP49454 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPFP49454 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPFP49454 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPFP49454 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPFP49454 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPFP49454 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPFP49454 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPFP49454 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPFP49454 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPFP49454 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPFP49454 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPFP49454 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPFP49454 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPFP49454 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPFP49454 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPFP49454 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPFP49454 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPFP49454 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPFP49454 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPFP49454 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPFP49454 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPFP49454 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPFP49454 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPFP49454 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPFP49454 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPFP49454 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPFP49454 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPFP49454 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPFP49454 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CENPFP49454 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CENPFP49454 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPFP49454 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPFP49454 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPFP49454 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPFP49454 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPFP49454 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPFP49454 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPFP49454 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPFP49454 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPFP49454 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPFP49454 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPFP49454 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPFP49454 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPFP49454 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPFP49454 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPFP49454 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPFP49454 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPFP49454 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPFP49454 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPFP49454 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPFP49454 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPFP49454 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPFP49454 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPFP49454 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPFP49454 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPFP49454 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPFP49454 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms