Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNTBP49356 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNTBP49356 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FNTBP49356 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTBP49356 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTBP49356 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTBP49356 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTBP49356 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTBP49356 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTBP49356 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTBP49356 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTBP49356 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNTBP49356 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNTBP49356 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNTBP49356 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNTBP49356 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNTBP49356 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FNTBP49356 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNTBP49356 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNTBP49356 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTBP49356 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTBP49356 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTBP49356 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTBP49356 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTBP49356 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTBP49356 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTBP49356 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTBP49356 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTBP49356 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTBP49356 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTBP49356 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTBP49356 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTBP49356 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTBP49356 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTBP49356 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTBP49356 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTBP49356 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTBP49356 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTBP49356 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTBP49356 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTBP49356 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTBP49356 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTBP49356 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTBP49356 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTBP49356 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTBP49356 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTBP49356 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNTBP49356 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNTBP49356 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNTBP49356 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNTBP49356 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNTBP49356 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNTBP49356 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNTBP49356 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNTBP49356 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNTBP49356 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNTBP49356 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNTBP49356 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FNTBP49356 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNTBP49356 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FNTBP49356 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNTBP49356 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FNTBP49356 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNTBP49356 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FNTBP49356 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNTBP49356 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNTBP49356 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNTBP49356 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNTBP49356 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNTBP49356 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNTBP49356 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNTBP49356 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNTBP49356 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNTBP49356 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTBP49356 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTBP49356 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTBP49356 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTBP49356 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTBP49356 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTBP49356 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTBP49356 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTBP49356 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTBP49356 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTBP49356 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTBP49356 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTBP49356 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTBP49356 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTBP49356 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTBP49356 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTBP49356 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTBP49356 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNTBP49356 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNTBP49356 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNTBP49356 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNTBP49356 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FNTBP49356 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNTBP49356 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNTBP49356 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNTBP49356 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FNTBP49356 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms