Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNI2P48788 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNI2P48788 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms